Noch abgelegener sind buddhistische Tempel, von denen einige Übernachtungsgäste aufnehmen. Während manche dieser Tempel den Gästen gestatten an der Zazen-Meditation teilzunehmen, bieten andere lediglich einige Zimmer als Nachtlager für zahlende Gäste.

In Japan gibt es etwa 360 Jugendherbergen, die saubere und einfache Schlafplätze zu äußerst günstigen Preisen anbieten. Einige dieser Herbergen stehen Allen offen, die privat geführten Jugendherbergen verlangen jedoch eine Mitgliedschaft im Japanischen Jugendherbergsverband (Japan Youth Hostels, Inc.) oder im Internationalen Jugendherbergsverband. Letzterem können Sie entweder in Ihrem Heimatland oder in dessen Zentrale in Tokyo beitreten.

Entgegen der im Namen angedeuteten Zielgruppe gibt es keine Altersbeschränkung für Jugendherbergsgäste. Verglichen mit den anderen Arten von Unterkünften gibt es jedoch wesentlich mehr Vorschriften, an die sich die Gäste halten müssen. Eine Übernachtung in einer Jugendherberge schlägt für gewöhnlich mit etwa 2.800 bis 3.000 Yen pro Person ohne Mahlzeiten zu Buche.

Welcome Inn Reservation Center: Diese Einrichtung wird vom International Tourist Center of Japan (TIC) betrieben und bucht Unterkünfte, die den folgenden Kriterien entsprechen: (1) Ausländische Gäste müssen willkommen sein und (2) der Preis für eine Übernachtung darf 8.000 Yen für ein Einzelzimmer und 13.000 Yen für ein Doppelzimmer nicht überschreiten. „Welcome Inns“ in verschiedenen Städten nehmen an diesem Programm teil. Darunter befinden sich verschiedene Arten von Unterkünften, von Ryokan über Minshuku bis hin zu Business Hotels, Pensionen und „People’s Lodge“ genannten günstigen Herbergen, die oft von lokalen Regierungen betrieben werden.